Constrained evolution of a core winter proteome across independently cold-adapted PACMAD grasses
该研究通过比较蛋白质组学分析发现，尽管PACMAD亚科草类独立进化出耐寒性，但其核心冬季蛋白质组的响应幅度受到进化约束而高度保守，且LEA3蛋白的结构完整性（如重复序列和基序）对于实现抗冻保护至关重要，仅靠转录诱导不足以保证耐寒性。
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evolutionary biology
259 篇论文
进化生物学探索生命如何随时间变化与适应，揭示从微小基因变异到复杂物种形成的奇妙旅程。在这里，我们关注生命之树的生长脉络，解读自然选择如何塑造地球上纷繁多样的生物形态。
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下方为您呈现近期在进化生物学领域发布的最新研究论文。
Dental calculus as a record of Pleistocene reindeer oral, digestive and dietary flora
该研究利用古代宏基因组学技术，通过对法国更新世驯鹿牙结石的测序分析，揭示了其口腔与消化微生物组及饮食结构的时空演变，证明了牙结石是重建已灭绝种群生态历史及追踪数千年消化适应连续性的有力工具。
Phylogenetic estimation of diversity-dependent biogeographic rates using deep learning
本文提出了一种名为 DDGeoSSE 的全生成式事件模型，结合深度学习技术克服了多样性依赖生物地理速率推断中似然函数不可计算的难题，并通过加勒比安乐蜥和云林荚蒾的研究证实了局部物种丰富度对物种多样化动态具有显著影响。
The effect of age and sex on the rate of de novo mutations in barn owls
该研究利用 33 个家燕亲代 - 子代三元组，证实了仓鸮的突变率与具有相似世代时间的雀形目鸟类相当，且父系传递的突变数量是母系的两倍，并首次为鸟类生殖细胞衰老提供了直接证据，表明父系年龄显著影响突变积累。
Summary statistics and approximate bayesian computation are comparable to convolutional neural networks for inferring times to fixation
该研究表明，在单时间点单群体的基因型数据中，基于原始数据的机器学习模型在推断硬选择清除的固定时间方面，并未比传统的汇总统计方法更具优势，暗示此类数据中可能已不存在能更好区分固定时间与选择发生时间的未被发现的信号。
TriMouNet: An Algorithm for Inferring Level-1 Phylogenetic Networks from Multi-Locus Gene Tree Distributions.
本文提出了 TriMouNet 算法，该方法通过分析多基因座数据集的基因树拓扑与分支长度分布来推断最佳三节点网络（trinets）并评估其统计支持度，进而将其整合为水平-1 系统发育网络，从而在准确基因树条件下以低假阳性率识别网状进化事件，有效克服了传统串联法因模型假设违背而导致的错误推断问题。
Making friends in an asymmetric game: the establishment of male-female grooming exchanges in vervet monkeys
该研究通过对野生绿猴异性梳理交换行为的观察发现，雌性采取“全押”策略而雄性部分符合“逐步加码”策略，最终双方达到互惠平衡，表明理解合作策略需结合生活史参数以解释现实中的复杂性。
Conservation and divergence of sex-biased gene expression across 50 million years of Drosophila evolution
该研究通过分析 6 种果蝇在 2000 万至 5000 万年间的演化数据，揭示了性偏基因表达在头部与身体组织间存在显著的保守性与周转差异，并指出其演化主要受自然选择驱动，且多数新出现的性偏表达源于两性间幅度不同但方向一致的协同调控变化，而非性拮抗的解决。
Life-stage-specific specialities in the cell atlases of the Clytia hemisphaerica planula and medusa
该研究利用单细胞转录组学构建了水母* Clytia hemisphaerica* 浮浪幼虫的细胞图谱，并将其与成体水母图谱进行对比，揭示了两者在细胞大类上的保守性以及幼虫阶段特有的细胞类型和区域化特征，表明幼虫与成体细胞之间存在基于基因标记的谱系对应关系而非精确的细胞身份一一对应。
Mutational divergence over years in local populations of the selfing nematode Caenorhabditis elegans
该研究通过对法国桑特伊尔林地中自交线虫（*C. elegans*）自然种群长达 13 年的时空采样与全基因组测序，揭示了其突变积累模式、染色体特异性突变偏好及约每年 25 代的有效繁殖率，并证实了该物种在百米尺度上存在显著的有限扩散特征。