The gene ivory:mir-193 controls scale type differentiation in Heliconius butterflies
该研究通过 CRISPR 基因编辑和单核转录组测序证实，Heliconius 蝴蝶中的 ivory:mir-193 基因座是控制鳞片类型分化的关键遗传热点，其中 ivory 驱动翅膀图案变异，而 mir-193 则通过作为共转录终止子介导下游鳞片命运的多样性。
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evolutionary biology
466 篇论文
Taming the Genetic Fire: Transposable Element diversity across thermal environments in polychaetes
该研究以多毛类环节动物为模型，揭示了热环境的不稳定性会抑制转座元件的多样性，表明转座元件多样性可能受到自然选择的调节，以平衡由热胁迫诱导的转座激活与维持基因组整体突变率之间的稳态。
Early development of Neanderthals revealed through virtual microanatomy
该研究利用非破坏性微计算机断层扫描技术分析了德国出土的三具尼安德特人幼体化石，发现其胎儿骨骼发育模式与现代人类基本一致但存在局部加速生长现象，而乳牙中异常的牙本质矿化则提示其可能患有某种全身性疾病。
A mathematical synthesis of genetics, development, and evolution
该论文提出了一种名为“进化发育动力学”的数学理论，通过精确整合多基因座遗传、发育与进化过程，揭示了发育如何塑造适应景观并约束进化路径，从而为解决遗传变异维持、停滞悖论等长期难题提供了新的理论框架。
Tracing the expansion of p53 retrogenes in elephant species: A foundation for functional insights.
本研究利用高质量基因组数据首次揭示了亚洲象（29 个）与非洲象（18-19 个）TP53 假基因在拷贝数、序列变异及染色体 27 上成对排列的复杂扩增模式，阐明了通过大片段基因组重复和染色体倒位驱动的进化机制，为理解大象癌症抵抗及庞贝悖论奠定了重要基础。
Systematics, diversification, and biogeography of Macromiidae (Odonata: Anisoptera)
本研究利用锚定杂交富集数据构建了大蜓科（Macromiidae）迄今最密集的系统发育框架，揭示了其晚渐新世起源、主要类群的地理分化历史以及雄性生殖器性状的演化模式，并指出其多样化速率主要受非栖息地相关因素驱动。
Parallel evolution of industrial melanism in the peppered moth: one locus, many alleles
该研究揭示了英国和欧洲大陆工业黑化现象虽均由同一基因（ivory）的变异驱动，但分别由不同的转座子插入和缺失等结构变异（如英国的 carb-TE 和欧洲的 sollichau）独立演化而来，表明同一适应性性状在物种内可存在多种遗传起源。
Recurrent evolution of cryptic triploids in cultivated enset increases yield
该研究通过新组装的基因组和大规模样本分析，首次揭示埃塞俄比亚主粮作物恩塞特（Ensete ventricosum）中约 20% 的栽培品种为独立演化多次的三倍体，且因产量更高而受到农民长期选择，这为利用其遗传多样性进行科学育种以改善非洲粮食安全提供了关键资源。
Early transcription factor activation distinguishes symbiotic from non-symbiotic bacteria during microbiome processing in a sponge
该研究通过在海绵 *Amphimedon queenslandica* 中比较共生与非共生细菌的摄取过程，发现转录因子（如 NF-κB、IRF 和 STAT）在吞噬共生菌后迅速发生核转位并激活，从而在效应反应之前确立了宿主对有益微生物的早期识别与区分机制。
The fate of horizontally acquired genes: rapid initial turnover followed by long-term persistence
该研究通过分析细菌基因组数据发现，水平基因转移事件具有“快速初始淘汰、长期稳定保留”的特征，即绝大多数跨门基因在获得后迅速丢失，而少数能长期存留的基因通常具有运输和代谢功能且拥有更多的蛋白质相互作用。
Temporal seascape genomics identifies evolutionary significant units in a highly exploited marine resource, the wedge clam Donax trunculus.
该研究利用高通量基因组数据揭示了楔形蛤（Donax trunculus）在伊比利亚半岛沿岸存在大西洋、巴利阿里海和阿尔沃兰海三个遗传显著单元，并发现不同渔区中性与适应性遗传多样性存在时间上的差异，据此建议未来应依据生物现实而非政治边界对这些单元实施独立管理以保障资源可持续利用。
Molecular Basis of Behavioral Diversity in a Sibling Species Trio
该研究通过比较三个果蝇近缘物种的脑区特异性基因表达，揭示了运动执行脑区在物种分化中高度保守而视觉系统高度分化的分子规律，并引入集合论方法有效筛选出驱动行为多样性的候选神经元基因。
Divergence in skeletal muscle growth by differential spatial hyperplastic patterning in teleost fishes
该研究通过比较多种鲤科鱼类，揭示了肌肉干细胞中细胞外基质基因的特异性表达及其介导的超生性空间模式差异，是调控鱼类骨骼肌生长多样性的关键机制。
Geomorphic evolution of a Caribbean biological hotspot
该研究通过整合高分辨率地形数据与海平面模型，重构了巴拿马博卡斯德尔托罗群岛的地质演化历史，揭示了全新世以来岛屿隔离与浅海生境扩张的动态过程，并证实岛屿面积、海拔及隔离后的累积生境可用性是解释陆生脊椎动物多样性的关键因素，从而为理解大陆架群岛的生态演化提供了时间校准框架。
The ivory:mir-193 non-coding RNA gene controls melanic camouflage in a polymorphic moth
该研究利用基因组关联分析、表达谱及 CRISPR 基因编辑技术，证实了非编码 RNA 基因*ivory:mir-193*通过调控其启动子区域的顺式变异和 miRNA 表达，作为关键主效基因控制着*Anticarsia gemmatalis*蛾类多态性中黑色素伪装表型的发育与演化。
Convergent evolution of red pigmentation in extrafloral nectaries: global patterns and mechanisms
该研究通过对全球 625 种植物的综合调查与实验验证，首次揭示了植物花外蜜腺红色色素的广泛趋同进化现象，并证明寒冷湿润区与沙漠是其主要分布热点，且其进化驱动力主要源于真菌防御功能。
Convergent evolution through independent rearrangements in the primate amylase locus
该研究利用 53 种灵长类物种的高质量基因组数据，揭示了灵长类淀粉酶基因座通过独立的重复事件（由长末端重复逆转录转座子插入引发结构不稳定性，随后由非等位同源重组驱动）在不同谱系中发生了趋同进化，导致胰腺和唾液腺中的表达模式趋同及功能分化。
Environmental effects overtake selection to shape avian body size
该研究基于北美 159 种鸟类的长期数据，发现其体重分布正呈现整体下降、变窄及失去重个体尾部的趋势，且这种变化主要由表型可塑性而非自然选择驱动，表明体型缩小可能是可逆的。
The importance of postzygotic barriers at the early stages of speciation in trees
该研究通过夏威夷树梅（Metrosideros polymorpha）四个变种的杂交实验发现，尽管植物界普遍被认为以合子前隔离为主，但树木的生态物种形成在早期阶段主要依赖合子后隔离机制，且这种模式在稳定环境中可能通过强化作用得以巩固。
Benchmarking Geometric Morphometric Methods: A Performance Evaluation for Gastropod Shell Shape Analyses
该研究利用多态性显著的滨螺（*Littorina saxatilis*）作为模型，系统评估并比较了椭圆傅里叶分析、基于地标点的几何形态测量学以及基于生长模型的 ShellShaper 三种方法在聚类能力、生物学可解释性及稳健性等方面的表现，从而为不同研究目标下的形态分析方法选择提供了明确指南。